Przed rozpoczęciem pracy z programem należy go zainstalować. Nie powinno z tym być żadnych problemów - po pierwszym włożeniu płytki CD do napędu i automatycznym uruchomieniu się programu jednym z aktywnych przycisków będzie przycisk Zainstaluj. Po kliknięciu na nim program automatycznie skopiuje niezbędne do swojej pracy pliki na dysk. Wersje wydane przed 2004 rokiem kopiują tylko kilka niewielkich plików i cały proces trwa kilka sekund. Wersja z 2004 roku ma część plików wspólnych ze Sposobem na dysleksję i jej instalacja wymaga skopiowania tych plików na dysk, w związku z czym trwa dłużej.
By nieco przyspieszyć pracę programu można skopiować na dysk dodatkowe pliki - czytanie zawartych w nich informacji z dysku będzie znacznie szybsze niż czytanie z płytki. W tym celu należy kliknąć na przycisku Zmień typ instalacji, wybrać gdzie mają być przechowywane pliki i kliknąć na przycisku Zmień.
Do uruchomienia programu zawsze niezbędne jest umieszczenie płytki CD w napędzie - bez jej obecności Dyslektyka nie da się uruchomić.
Program można w każdej chwili usunąc z dysku - w tym celu po włożeniu płytki do napędu i po uruchomieniu się programu startowego należy kliknąć na przycisku Usuń. Usunięte zostaną nie tylko pliki programu, ale i wyniki dzieci, zapisane przez nadzorcę (chyba, że zainstalowany jest również Sposób na dysleksję - wtedy wyniki dzieci zostaną usunięte razem z ostatnim usuwanym programem).
